Одним из важных направлений деятельности Челябинского государственного историко-культурного заповедника «Аркаим» является публикация результатов научных исследований археологических памятников «Страны городов» эпохи бронзы, а также объектов других исторических эпох, вмещающих природных ландшафтов и традиционных культур Зауральской степи. Со статьями сотрудников заповедника, вышедшими в различных российских и международных изданиях, можно познакомиться на сайте научной электронной библиотеки Elibrare.ru в разделе заповедника. Целый ряд научных и научно-популярных изданий заповедника размещены в международной социальной сети сотрудничества учёных Academia.edu здесь. Ниже приводятся данные обо всех научных и научно-популярных изданиях, выпущенных Заповедником «Аркаим» и при его участии с момента создания заповедника в 1994 году. Для большинства изданий, наряду с библиографическим описание и аннотацией, даны также ссылки для скачивания бесплатной электронной версии в формате PDF, предназначенной исключительно для ознакомления и некоммерческого использования.
Специализир. природ.-ландшафт. и ист.-археол. Центр "Аркаим", Ин-т истории и археологии Ур. отд-ния РАН ; [сост.: Д.Г. Зданович и др.]. - Челябинск : Южно-Уральское книжное издательство, 2002. - 214 с.

Монография содержит полную публикацию археологических, антропологических, археозоологических и археоастрономических материалов, полученных при раскопках кургана 25 Большекараганского могильника – некрополя укрепленного поселения Аркаим эпохи средней бронзы.

Выпуск 1. Челябинск, 2002. – 92 с.

Вестник общества открытых исследований древности – научное периодическое издание. Он объединяет работы молодых исследователей уральского региона, посвященные актуальным проблемам и новым подходам к древней истории и духовной культуре Евразии.

Выпуск 2. Челябинск, 2002. – 160 с.

Второй выпуск Вестника общества открытых исследований древности посвящен исследованиям по истории духовной культуры народов Евразии.

Челябинск: Юж.-Урал. Кн. Изд-во, Юж.-Урал. Изд.-торг. Дом, 2001 – 246 с.

Учебное пособие для учащихся старших классов школ, гимназий, лицеев, колледжей, средних специальных и профессиональных учебных заведений посвящено природе и экологии Челябинской области. Это первое в регионе и одно из первых подобных изданий в регионах России.

Челябинск: Юж.-Урал. кн. изд-во, Юж.-Урал. изд. -торг. дом, 2001. – 108 с.

Монография содержит историко-философский анализ эсхатологического мифа.

Челябинск: Юж.-Урал. Кн. Изд-во, Юж.-Урал. Изд.-торг. Дом, 2001 – 246 с.
Погребения аркаимского культурного круга лучше всего документированы могильником Синташта. Эти погребения, как и те, которые обнаружены на других памятниках аркаимского типа, сильно различаются в своих деталях; их различия – отдельная аналитическая проблема. Тем не менее, взятые в качестве группы, эти погребения, как показал В.Ф. Генинг, археологически свидетельствуют о многих аспектах погребальных ритуалов, описанных в текстах древнего индоиранского происхождения, а именно в Ригведе и Авесте (Генинг, 1977; Gening, 1979). Они, таким образом, представляют в наше распоряжение одно из наиболее ранних свидетельств существования культуры, которая почти с полной уверенностью может быть названа индоевропейской, если не индоиранской.
Труды музея-заповедника «Аркаим» / науч. Ред. С.Я. Зданович / Спец. природ.-ландшафт и ист.-археол. Центр «Аркаим», ин-т истории и археологии УрО РАН – Челябинск, 2000. - 188 с.

Настоящий сборник продолжает серию публикаций совместных работ археологов и специалистов естественных наук, выполненных на материалах музея-заповедника Аркаим.

Под ред. Л.Л. Гайдученко. Челябинск: Челяб. гос. ун-т, 1999. 297 с.

В сборнике представлены материалы о природных системах музея-заповедника «Аркаим» и его окрестностей в древности и современности.